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Suite à l'appel d'offre lancé en 2001 par le Ministère de la Recherche visant la mise en place d'Observatoires de Recherche en Environnement (ORE), le LISAH, l'UMR HSM (Montpellier), l'INAT (Tunis) et l'INRGREF (Tunis) ont mis en place un observatoire sur leurs thématiques de recherche, l'Observatoire Méditerranéen de l'Environnement Rural et de l'Eau (OMERE), à partir de deux sites qui faisaient l'objet d'observations hydrologiques depuis une dizaine d'années : Roujan (Hérault-France) et Kamech (Cap Bon-Tunisie).

L'ORE OMERE s'inscrit dans le contexte de l'étude des changements globaux affectant les hydrosystèmes et se focalise sur les agrosystèmes méditerranéens. Il s'agit d'un contexte hydrologique intermédiaire entre milieux arides et tempérés, soumis à une gamme étendue de processus hydrologiques, allant des phénomènes de sécheresse intenses aux crues extrêmes et inondations. D'autre part, il s'agit d'un contexte social et humain, où les actions anthropiques sont millénaires et généralisées, et qui subit actuellement des évolutions considérables (intensification des productions agricoles dans les terroirs favorables, déprises dans les terroirs non intensifiables, augmentation des captages, aménagements hydro-agricoles ou de conservation du milieu) liées notamment à un accroissement rapide de la densité de population. Il s'agit aussi de latitudes où les différents scénarios élaborés par l'IGCC sur le changement climatique prévoient les modifications pluviométriques les plus importantes : raréfaction des précipitations d'hiver, augmentation des précipitations orageuses, augmentation des pluies extrêmes…

L'ORE OMERE repose sur l'acquisition de chroniques climatiques, hydrologiques, de flux de sédiments et de solutés sur deux hydrosystèmes méditerranéens, similaires du point de vue du forçage climatique, différents du point de vue des sols, des aménagements hydro-agricoles et des pratiques culturales et qui subissent des dynamiques différentes d'évolution :

L'observatoire a été labellisé en 2003 (homogénéisation des équipements), re-labellisé fin 2005 puis à nouveau en 2010 pour 4 ans.